A pihenőnap utáni szakaszon a sprintereké volt a főszerep, a mezőnyhajrán Caleb Ewan volt ismét a leggyorsabb, a szakasz vesztese Jakob Fuglsang volt, aki egy bukást követően feladni kényszerült a versenyt.
A Tour de France 16. szakaszán 177 km várt a Francia Körverseny mezőnyére, mely túl sok szintet nem tartalmazott. Várható módon a sprinterek szerették volna maguknak ezt a szakaszt, mert ezután már csak a párizsi befutón lesz esélyük harcba szállni egy szakaszgyőzelemért.
A rajt után egy 5 fős szökés – Lars Bak, Stéphane Rossetto, Paul Ourselin, Lukas Wisnowski, Alexis Gougeard – tudott elmenni, melyet a sprinterek csapatai folyamatosan rövid pórázon tartottak, egy másodpercig sem volt kérdés, hogy mezőnyhajrával fog végződni a mai szakasz. Az utolsó kilométereken fogták meg a szökevényeket, majd már kezdődött is a hajrá, Caleb Ewan egész hátulról indította meg a sprintjét, közben majdnem fennakadt egy QuickStep-es segítő kerekén is, de végül magabiztosan elsőként haladt át a célvonalon. A második Elia Viviani lett, harmadikként pedig Dylan Groenewegen zárta a szakaszt. Az összetettben érdekeltek közül egy bukást követően Jakob Fuglsang feladta a versenyt. Geraint Thomas is elesett a szakasz során, de látszólag nem történt baja, folytatni tudta a versenyt.
A 16. szakasz eredménye:
| 1 | Caleb Ewan (Aus) Lotto Soudal | 3:57:08 | |
| 2 | Elia Viviani (Ita) Deceuninck-QuickStep | ||
| 3 | Dylan Groenewegen (Ned) Team Jumbo-Visma | ||
| 4 | Peter Sagan (Svk) Bora-Hansgrohe | ||
| 5 | Niccolò Bonifazio (Ita) Total Direct Energie | ||
| 6 | Michael Matthews (Aus) Team Sunweb | ||
| 7 | Matteo Trentin (Ita) Mitchelton-Scott | ||
| 8 | Jasper Stuyven (Bel) Trek-Segafredo | ||
| 9 | Alexander Kristoff (Nor) UAE Team Emirates | ||
| 10 | Andrea Pasqualon (Ita) Wanty-Gobert |
Az összetett állása a 16. szakasz után
| 1 | Julian Alaphilippe (Fra) Deceuninck-QuickStep | 64:57:30 | |
| 2 | Geraint Thomas (GBr) Team Ineos | 0:01:35 | |
| 3 | Steven Kruijswijk (Ned) Team Jumbo-Visma | 0:01:47 | |
| 4 | Thibaut Pinot (Fra) Groupama-FDJ | 0:01:50 | |
| 5 | Egan Bernal (Col) Team Ineos | 0:02:02 | |
| 6 | Emanuel Buchmann (Ger) Bora-Hansgrohe | 0:02:14 | |
| 7 | Mikel Landa (Spa) Movistar Team | 0:04:54 | |
| 8 | Alejandro Valverde (Spa) Movistar Team | 0:05:00 | |
| 9 | Rigoberto Uran (Col) EF Education First | 0:05:33 | |
| 10 | Richie Porte (Aus) Trek-Segafredo | 0:06:30 |
